Sinds het eerste geval van de ziekte door het coronavirus, in december 2019, heeft de pandemische ziekte zich naar miljoenen mensen over de hele wereld verspreid.Deze wereldwijde pandemie van de romanernstig acuut respiratoir syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2)is een van de meest dwingende en zorgwekkende mondiale gezondheidscrises van de moderne tijd, die grote bedreigingen voor de wereld met zich meebrengt en alle aspecten van het menselijk leven beïnvloedt.[1]
Coronavirussen zijn omhulde, positief-sense, enkelstrengige RNA-virussen uit de Coronaviridae-familie, die een breed spectrum aan gastheren hebben, zoals mensen, vleermuizen, kamelen en vogelsoorten, inclusief vee en gezelschapsdieren, die een bedreiging vormen voor de volksgezondheid. 1 Coronavirussen worden geclassificeerd in de subfamilie van Orthocoronavirinae, die verder is onderverdeeld in vier geslachten, op basis van verschillen in eiwitsequenties: a-coronavirus, b-coronavirus, g-coronavirus en d-coronavirus.De a-coronavirussen en b-coronavirussen infecteren alleen zoogdieren, terwijl g-coronavirussen en d-coronavirussen voornamelijk vogels infecteren, hoewel sommige ook zoogdieren kunnen infecteren.HCoV-229E,
ov-OC43, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, SARSCoV, MERS-CoV en SARS-CoV-2 zijn de zeven coronavirussen waarvan is vastgesteld dat ze mensen infecteren.Onder hen zijn SARSCoV en MERS-CoV, die in 2002 en 2012 onder de menselijke bevolking zijn opgedoken, zeer pathogeen.Terwijl de stammen van het menselijke coronavirus (HCoV)-229E, HCoV-NL63, HCoV-OC43 of HCoV-HKU1 die in de menselijke bevolking circuleren alleen verkoudheid veroorzaken,7 is het ernstige acute respiratoire syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV2), de veroorzaker van COVID-19 is een nieuw b-coronavirus dat eind 2019 al vroeg opdook en tot verwoestende sterfgevallen heeft geleid.De voornaamste symptomen vanCOVID 19zijn vergelijkbaar met die van SARS-CoV en MERS-CoV: koorts, vermoeidheid, droge hoest, pijn in de bovenborst, soms diarree en kortademigheid.In tegenstelling tot vroegerbesmettingen met het coronavirus (CoV).De snelle mondiale verspreiding, de hoge transmissiesnelheid, de langere incubatietijd, de meer asymptomatische infecties en de ernst van de ziekte van SARS-CoV-2 vereisen diepgaande kennis over de strategieën voor virale immuunontduiking.
Net als andere menselijke coronavirussen (SARS-CoV-2, MERS-CoV) heeft SARSCoV-2 ook een enkelstrengig, positief-sense-RNA-genoom van ongeveer 30 kb groot.Zoals weergegeven in Figuur 1 bundelen de virale nucleocapside (N) eiwitten het genoom tot een groot ribonucleoproteïne (RNP) complex, dat vervolgens wordt omhuld door lipiden en virale eiwitten S (spike), M (membraan) en E (envelop).Het 50e uiteinde van het genoom heeft twee grote open leesframes (ORF's), ORF1a en ORF1b, die coderen voor de polypeptiden pp1a en pp1b, die worden geproduceerd in 16 niet-structurele eiwitten (NSP's) die elk aspect van virale replicatie omvatten door virale proteasen NSP3 en NSP5 die respectievelijk een papaïne-achtig proteasedomein en een 3C-achtig proteasedomein.9 Het 30-uiteinde van het genoom codeert voor structurele eiwitten en de bijkomende eiwitten, waarvan is bewezen dat ORF3a, ORF6, ORF7a en ORF7b betrokken zijn bij de virale structurele eiwitten. bij de vorming van virale deeltjes en ORF3b en ORF6 functioneren als interferonantagonisten.Volgens de huidige annotatie op basis van sequentie-overeenkomst met andere b-coronavirussen omvat SARS-CoV-2 voorspellingen van zes hulpeiwitten (3a, 6, 7a, 7b, 8 en 10).Nog niet al deze ORF’s zijn echter experimenteel gevalideerd en het exacte aantal bijkomende genen van SARS-CoV-2 is nog steeds een twistpunt.Daarom is het nog steeds onduidelijk welke bijkomende genen daadwerkelijk tot expressie worden gebracht door dit compacte genoom.[2]
Zeer gevoelige en specifieke tests zijn van cruciaal belang voor het identificeren en behandelen van COVID-19-patiënten en voor het implementeren van controlemaatregelen om de uitbraak te beperken.Point-of-care (POC) moleculaire tests hebben het potentieel om eerdere detectie en2 isolatie van bevestigde SARS-CoV-2-gevallen mogelijk te maken, vergeleken met laboratoriumgebaseerde diagnostische methoden, waardoor de overdracht binnen huishoudens en gemeenschappen wordt verminderd.
[1]Klinische en operationele impact van snelle SARS-CoV-2-detectie op een zorgafdeling
[2] De strijd tussen gastheer en SARS-CoV-2: aangeboren immuniteit en strategieën voor het ontwijken van virussen
Posttijd: 25 mei 2022